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石河子大学医学院的前身是1949年中国人民解放军解放新疆进军途中成立的第一兵团卫生学校，1996年四校合并进入石河子大学。在75年的砥砺发展中，始终坚持立德树人，把培养适应区域经济社会发展的高素质医疗卫生人才作为根本任务，为国家和新疆培养了各级各类医药卫生人才2万余名。

学院拥有基础医学、临床医学、护理学、公共卫生与预防医学4个一级学科授权点，临床医学、口腔医学、护理学和公共卫生硕士4个专业学位授权领域。其中临床医学进入ESI前1%。学院现开设8个本科专业：临床医学、口腔医学、护理学、预防医学、医学影像学、医学检验技术、康复治疗学、健康服务与管理，其中临床医学专业为国家级特色专业、国家级一流专业，入选教育部“卓越医师培养计划”。临床医学、护理学、口腔医学顺利通过教育部医学教育专业认证。

学院建成总面积达24000平方米的医学综合实验楼，有1个省级实验教学示范中心，拥有体系较为完备形态、机能、技能实验分中心及护理学、口腔医学、医学预防、医学影像、医学检验技术专业实验室教学实验室及标准化OSCE考站等，教学设备总值达5000万余元。现有拥有8所附属医院（其中直属附属医院1所，非直属附属医院7所），14所教学、实习医院，其中三级甲等医院13所，以及5个公共卫生教学实习基地。

学院现有专职教师157人，其中具有博士学位教师65人，高级职称85人，享受政府特殊津贴专家2人，获“宝钢优秀教师奖”2人，自治区/兵团教学名师3人，有各类省部级及以上人才称号老师19人。临床兼职教师979人，具有博士学位55人，高级职称348人；外聘兼职教师9人。博士生导师28人，硕士生导师325人。现有全日制在校本科生3378人，硕士研究生1035人，留学生386人。