生命科学学院由原农学院生物基础部、生物技术中心和兵团师范专科学校生化系生物教研室于1999年合并成立了石河子大学生物科学系，2001年成立生物工程学院，2004年更名为生命科学学院。生物学为“国家一流学科”建设支撑学科、自治区重点学科，设有植物学、生物化学与分子生物学、遗传学、干旱区生物多样性科学等4个学科方向。拥有生物学一级学科博士、硕士学位授予点和生物与医药专业学位授予点、学科教学（生物）专业学位授权点，生物学博士后科研流动站。农业科学、植物与动物科学、环境/生态学三个学科进入ESI全球学科排名前1%。

  学院设有生物科学（含菁英班、师范类方向）、生物技术、生物育种科学3个本科专业。生物科学专业入选国家一流本科专业建设点，生物技术专业入选省级一流本科专业建设点。拥有国家级“生命科学人才培养模式改革”和“植物学”虚拟教研室。

  现有教职员工81人，专任教师62人，教授23人，副教授33人，博士生导师26人。教师中获国家级人才称号2人、省级人才称号20人，石河子大学“3152”学科带头人7人和优秀中青年骨干教师6人。宝钢优秀教师1人。在聘“天池英才”特聘教授1人、海外教授1人。学院有“绿洲城镇与山盆系统生态”兵团重点实验室、“新疆植物药资源利用”教育部重点实验室（独立方向）、“新疆特殊植物基因资源的研究与利用”兵团科技创新团队，以及“农业生物技术”和“新疆植物资源与生态”2个校级重点实验室。

  学院建成生物学领域完善的本科、硕士、博士人才培养体系。学生获得中国国际“互联网+”创新创业大赛银奖、全国大学生生命科学竞赛一等奖等国家、省部级学科竞赛奖励150余项（次）。