农学院成立于1959年，是全国党建工作标杆院系、全国民族团结示范单位。现有1个国家重点学科，2个兵团重点学科，建有张献龙院士工作站。设有作物学博士后流动站，作物学、园艺学2个一级学科博士点，作物学、园艺学、农业资源与环境、植物保护、城乡规划学5个一级学科硕士点，农业、林业2个研究生专业学位授权点，农学*、种子科学与工程*、植物保护*、园艺*、设施农业科学与工程*、农业资源与环境、林学、园林、智慧农业9个本科专业，其中植物生产类五个专业实施大类招生（专业名称*标注）。

  学院现有专任教师146人，其中教授64人，副教授67人，具有博士学位的128人。其中，有全国模范教师1人，全国民族团结先进个人1人，国务院特殊津贴专家4人，教育部新世纪优秀人才2人，农业部有突出贡献的中青年专家1人，省部级突出贡献专家、兵团英才、天山英才等人才称号教师57人次，自治区农业产业技术体系专家11人。

  学院拥有部省共建国家重点实验室培育基地—兵团绿洲生态农业重点实验室，绿洲作物高效生产与农业环境保护国家国际科技合作基地、新疆兵团农业大数据国家地方联合工程研究中心、兵团特色果蔬栽培生理与种质资源创新利用重点实验室、新疆绿洲农业病虫害治理与植保资源利用自治区高校重点实验室、兵团林业害虫预测预报检验中心、自治区本科实验教学示范中心——植物生产类专业综合实验中心和国家级科普教育基地——石河子大学现代农业科普基地。

  建有国家级教学团队2个，国家级虚拟教研室1个，国家级一流专业4个，省级一流专业2个；国家一流课程3门，省级一流课程10门，国家级课程思政示范课1门，省级课程思政示范课3门。

  以立德树人为根本任务，学院建有本、硕、博人才培养体系，已经试点开展本硕博一体化培养，每年与华中农业大学、西北农林科技大学实施“2+1+1”联合培养，即将开展智慧农业本科留学生培养。近四年，本科生累计荣获中国国际“互联网+”大学生创新创业大赛金奖、“创青春”创业大赛金奖等国家、省部级学科竞赛奖励400余项（次）。